El protagonista anónimo, conocido solo como el niño, se muda con su abuela después de que se queda huérfano. El niño y su abuela son grandes amigos. Ella le cuenta muchas historias sobre brujas, específicamente cómo reconocerlas para que él esté a salvo de ellas. Aparte de algunas características físicas distintivas (son calvas, tienen garras y carecen de dedos de los pies), las brujas parecen mujeres humanas, pero son criaturas horribles que se aprovechan de los niños.
La abuela le advierte sobre la Gran Bruja, la líder más malvada y temida de todas las brujas. Cuando la abuela y el niño se van de vacaciones a un hotel elegante en la costa inglesa, el niño se encuentra con un grupo de brujas que se reúnen para su reunión anual. Oye a la gran bruja presentar su nuevo invento, algo que ella llama Fórmula 86, una poción para convertir a los niños en ratones. La bruja explica su plan de poner la poción en dulces y hacer que todas las brujas abran tiendas de dulces. Como parte de su presentación, la Gran Bruja atrae a un niño llamado Bruno Jenkins que es un invitado en el hotel y lo convierte en un ratón. Después de descubrir al niño, las brujas también lo convierten en un ratón.
El niño encuentra a Bruno y se da cuenta de que ambos aún recuperan su personalidad, voz e inteligencia a pesar de haber sido transformados. Al chico se le ocurre un plan para convertir a todas las brujas en ratones robando un poco de la poción y poniéndola en la comida de las brujas. El plan tiene éxito: todas las brujas se transforman instantáneamente en ratones y luego son asesinadas por el personal del hotel y los huéspedes.
Después de regresar a casa, el niño y la abuela idean un plan para usar la poción para erradicar a todas las brujas del mundo. El niño sigue siendo un ratón y solo vivirá otros nueve años; pero eso no le preocupa, ya que vivirá tanto como su abuela.
